全基因組甲基化測序文庫(WGBS)的堿基比例嚴重失衡(GC%~20%),這給高質量的測序數據交付帶來了極大的挑戰(zhàn)。通常,我們采用摻入高比例的專用平衡文庫(例如PhiX文庫、E.coli文庫)或與GC含量40%~50%的其他應用樣本Pooling測序的方法來緩解失衡,提高測序質量。然而,這種方法不僅降低了生產效率,還增加了測序的成本和操作的復雜性。
真邁生物高通量基因測序儀全系產品已實現“甲基化0%平衡文庫摻入”高質量測序。本次測試中,在0% PhiX平衡文庫摻入的條件下,Q30均值≥92%、單index測序數據拆分率均值≥98%,與跟堿基平衡文庫混合測序的NovaSeq 6000平臺數據表現相當。
【測試方案】
【測試結果】
(1)Q30均值達92%以上、單index 測序數據拆分率均值達98%以上
圖1A. FASTASeq 300_0% PhiX重復測序表現
圖1B. GenoLab M_0% PhiX重復測序表現
圖1C. SURFSeq 5000_0% PhiX重復測序表現
(2)數據比對表現優(yōu)異,達80%以上
圖2A. FASTASeq 300和GenoLab M平臺重復測序的Mapping Rate
圖2B. SURFSeq 5000重復測序的Mapping Rate
(3)甲基化類型和分布水平表現均高度一致
圖3A. 不同甲基化類型的比例
圖3B. 全基因組CG位點甲基化水平分布
真邁生物通過技術優(yōu)化升級,全系產品實現了“甲基化0%平衡文庫摻入”高質量測序。這一技術突破,進一步增強了真邁生物測序儀的產品力,為廣大用戶提供更為高效、經濟的測序平臺工具。
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撰稿:崔青美
編輯:市場部